急性尿道炎治疗的关键是及时性，不能讳疾忌医，胡乱服用抗生素类药物而不尊医嘱，极容易转变为慢性尿道炎。患者应该大量饮水，使尿量增加，排尿时可冲洗尿道分泌物；注意休息，急性期短期内避免性生活。
急性尿道炎采用抗生素与化学药物联合应用，疗效较好。近来氟哌酸与磺胺药物联合应用，临床效果满意。全身治疗应注意休息，补充足够液体。在急性期间，应避免性生活，否则会延长病程。同时可以服用多靶点作用的中药提高自身免疫力。
如利尿消炎丸等中药主要以清热解毒，利湿通淋为主，辅以补肾固本，活血化瘀，扶正祛邪，提高机体免疫力为组方之法。中西药结合有效治疗急性尿道炎，防止其发展为难以治愈的慢性尿道炎，西药快速治标，中药彻底治本，在临床上取得很好的临床效果。患者和医护人员都认同中西药结合治疗的方式，取之所长，补之所短。患者若有尿路刺激征，经常规抗菌治疗无效，且除外有复杂因素存在时，应考虑为支原体、衣原体或病毒感染，可首先使用四环素治疗。对四环素若有耐药性，则可改用红霉素、甲基红霉素或罗红霉素等。以上药物对支原体、衣原体有效。若经上述治疗仍无效，则可能为急性尿道综合征。
